Modulo cuentas por pagar

En el modulo de cuentas por pagar, en la opción traspaso de saldos entre proveedores, quiere decir que el saldo de un proveedor se lo puedo asignar a otro.

Sí, exactamente significa esto.
Internamente se crea una nota de crédito y una nota de débito para cada proveedor.
Si anulas una de ellas, el sistema anula ambas.